副猪嗜血杆菌S-核糖基高半胱氨酸酶基因序列分析与推导蛋白三维结构的分子模拟

• 作者: 丁耀忠 刘文倩 刘永生 张杰 王猛 赵娜 陈豪泰 马丽娜 马艳平
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 副猪嗜血杆菌 S-核糖基高半胱氨酸酶 序列分析 分子模拟
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 40-44
• 分类号: S855.12
• 语种: 中文

摘要

利用PCR方法获得副猪嗜血杆菌S-核糖基高半胱氨酸酶(luxS)基因全长DNA,将PCR纯化产物与pMD18-T载体连接并转化E.coil DH5α菌株,重组阳性质粒测序并采用生物信息学软件对所推导的氨基酸序列进行三维结构分析.结果表明,该基因全长510 bp,并与GenBank中登录的其他5株菌株luxS基因完整参考序列进行比较,同源性均在70%以上.用ExPAsy软件包预测了推导蛋白的特性,运用Swiss-PDB viewer软件的SWISS-Model处理器,并利用同源建模的思想建立HPS-luxS的三维结构.拉马钱德兰图证明,构建的luxS蛋白的空间结构是合理的.