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草莓miR156靶基因SPL9的克隆与表达分析
草莓miR156靶基因SPL9的克隆与表达分析
作者:
代红艳
刘月学
张志宏
李贺
赵晓初
马跃
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
草莓
SPL9
实时定量RT-PCR
miR156
摘要:
[目的]从草莓中克隆SPL(SQUAMOSA promoter binding protein-like)转录因子基因SPL9,并分析其在草莓植株不同生长时期的表达水平及与miR156的表达关系,探讨SPL9在草莓植株生长发育中的作用.[方法]根据苹果SPL基因家族的保守序列设计简并引物,以草莓叶片为试材,利用RT-PCR克隆草莓SPL9基因片段,在此基础上利用RACE方法克隆SPL9的cDNA全长.利用实时定量RT-PCR技术分析草莓叶片中SPL9及miR156的表达水平.[结果]从草莓(Fragaria×ananassa)品种'全明星'中克隆出SPL9基因的cDNA全长序列,命名为FaSPL9.其CDs长度为1 143 by,编码381个氨基酸,与拟南芥AtSPL9、葡萄VvSPL9、权PtSPL9、苹果MdSPL9以及玉米ZmSPL9的氨基酸序列同源性分别为:40.30%、64.57%、56.09%、70.33%、38.35%.FaSPL9有着高度保守的SBP结构域和一个双向核定位信号KRXXXRRRK.FaSPL9基因序列中包含miR156的靶位点,实时定量RT-PCR结果表明,在草莓植株的不同生长时期FaSPL9的表达量不同,且与miR156呈现相反的表达模式.[结论]从草莓中分离出FaSPL9基因,其作为miR156的靶基因,推测FaSPL9对草莓植株的生长发育具有重要的调控作用.
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文献信息
篇名
草莓miR156靶基因SPL9的克隆与表达分析
来源期刊
中国农业科学
学科
农学
关键词
草莓
SPL9
实时定量RT-PCR
miR156
年,卷(期)
2011,(12)
所属期刊栏目
园艺
研究方向
页码范围
2515-2522
页数
分类号
S668.4
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2011.12.013
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张志宏
沈阳农业大学园艺学院
114
1389
22.0
32.0
2
代红艳
沈阳农业大学园艺学院
45
577
14.0
23.0
3
李贺
沈阳农业大学园艺学院
58
482
13.0
20.0
4
刘月学
沈阳农业大学园艺学院
33
172
8.0
12.0
5
马跃
沈阳农业大学园艺学院
31
184
8.0
12.0
6
赵晓初
沈阳农业大学园艺学院
1
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引文网络
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草莓
SPL9
实时定量RT-PCR
miR156
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
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