布尔逻辑DNA序列比对系统的软件平台设计

• 作者: 冯萍 王进科 陈亚东
• 来源期刊: 科学技术与工程
• 学科: 工学
• 关键词: FPGA DNA序列 软件平台 动态规划
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 计算机技术
• 页码范围: 1468-1473,1479
• 分类号: TP311.1
• 字数: 3361字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-1815.2011.07.013

摘要

针对目前基于动态规划的DNA序列全局比对算法时间复杂度较高,设计了一个DNA序列全局比对系统.该系统用FPGA进行序列的比对,并配备一个软件平台存储数据、发送命令以及发送和接收数据.测试数据表明,该系统的DNA序列比对时间在序列相似度较低情况下,为Needleman的42%;在序列相似度较高的情况下,为Needleman的6%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯萍	西北工业大学计算机学院	37	204	9.0	12.0
2	陈亚东	西北工业大学计算机学院	2	3	1.0	1.0
3	王进科	西北工业大学计算机学院	2	3	1.0	1.0