广州桑树矮缩病植原体secE基因序列分析与蛋白结构预测

• 作者: 张丽君 张毅 罗焕亮 胡小华
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 广州桑树矮缩病 植原体 SecE基因 同源性 蛋白结构
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 1980-1983,2004
• 分类号: S888.71+9
• 字数: 3322字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2011.04.035

摘要

[目的]预测广州桑树矮缩病植原体secE蛋白的抗原性.[方法]应用PCR技术从典型矮缩症状的桑树植株总DNA中扩增到约400 bp的特异片段,将此片段克隆后与GeneBank中已报道的5种植原体的secE基因进行序列同源性分析,并对克隆基因所编码的蛋白进行理化性质、二级结构、跨膜区以及前导信号序列分析.[结果]该片段长411 bp,编码136个氨基酸的蛋白.桑树矮缩植原体与洋葱黄化植原体同源性最高,核苷酸和编码的氨基酸序列同源率分别为100%和99%.secE蛋白理化性质预测其理论等电点为9.33;二级结构主要为螺旋,其次为折叠和无规则卷曲,无转角;有3个明显的疏水区,易形成跨膜螺旋;有4个明显的抗原区域.[结论]该secE蛋白具有良好的抗原性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张毅	华南理工大学生物科学与工程学院	56	445	12.0	19.0
2	张丽君		55	402	10.0	17.0
3	罗焕亮		11	24	3.0	4.0
4	胡小华	华南理工大学生物科学与工程学院	3	7	1.0	2.0