4个地区独一味的ITS基因片段序列分析

• 作者: 杨小源 王昕 闵云山 顾秀琰
• 来源期刊: 中国当代医药
• 学科: 医学
• 关键词: 独一味 PCK ITS序列 分子系统进化
• 年，卷（期）: 2011,（16）
• 所属期刊栏目: 专家论坛
• 页码范围: 5-7
• 分类号: R931
• 字数: 1968字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-4721.2011.16.003

摘要

目的:检测独一味的ITS基因序列片段,并利用ITS序列作为遗传标记分析了来自4个不同地区(甘南玛曲、西藏林芝、四川若尔盖道班、四川若尔盖热当坝)的独一味的遗传变异情况.方法:采用Plant DNA Mini Kit法作为基因组DNA提取的最佳方法,提取植物独一味的核基因组DNA,并且建立了适合独一味的PCR反应体系,利用合成的特异性PCR引物对所提取的DNA中rRNA基因内转录间隔区序列进行套式扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳得到电泳图谱,并进行分析,测序.经Clusta 1X软件排序,MEGA3软件统计分析和分支分析,建立系统发育树,并计算各类群间的遗传距离.结果:琼脂糖电泳图谱及所测序列显示,来自于植物独一味的核DNA中rRNA基因内转录间隔区全长为670bp左右,甘南玛曲和西藏林芝的独一味遗传距离较小,四川与甘南玛曲和西藏林芝的独一味遗传距离较大.结论:基于ITS序列分析.作为品质突出的甘南玛曲独一味和其他地区的独一味相比,并未形成一个区别于其他地区独一味的一个独特的种.根据ITS序列特征所构建的系统树,与传统分类有所不同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	闵云山		22	51	4.0	5.0
2	杨小源		17	56	5.0	6.0
3	王昕		44	245	9.0	13.0
4	顾秀琰		22	61	4.0	5.0