猪Ⅱ型圆环病毒江苏株全基因进化及ORF3蛋白的生物信息学分析

• 作者: 孙荡 茅翔 高歌
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: PCV2 进化分析 ORF3蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医
• 页码范围: 881-885
• 分类号: S858.285.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2012.08.21

摘要

对NCBI已经登记的国内分离的PCV2江苏株(GQ358994.1)进行序列比对及进化分析,并对其ORF3编码蛋白的氨基酸序列进行生物信息学方法分析,对其组分、理化性质、跨膜结构域、二级结构、糖基化位点、磷酸化位点和B细胞抗原表位进行预测和推断.结果表明,PCV2江苏株与国内分离株序列同源性极高(＞99％),ORF3蛋白无跨膜区域,二级结构中自由卷曲含量最高,为54.81％,不含有糖基化位点,但有8个磷酸化位点.综合分析得出,ORF3蛋白具有大量的抗原决定簇.通过对ORF3蛋白进行生物信息学方法分析,为PRRSV疫苗设计提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙荡	南京农业大学动物医学院	3	4	1.0	2.0
2	高歌	南京农业大学动物医学院	5	5	1.0	2.0
3	茅翔	南京农业大学动物医学院	4	4	1.0	2.0