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猪博卡病毒(重庆株)NP1部分基因的克隆测序及生物信息学分析
猪博卡病毒(重庆株)NP1部分基因的克隆测序及生物信息学分析
作者:
叶星宇
聂奎
聂福平
原文服务方:
中国兽医杂志
猪博卡病毒
NP1基因
克隆
生物信息学
摘要:
通过设计特异性引物建立基于猪博卡病毒(Porcine Bocavivus,PBoV)NP1基因的特异性PCR方法,从重庆地区猪血液中扩增出PBoV-NP1的部分基因片段,进行基因测序,并与GenBank公布的PBoV、HBoV及PPV基因序列进行生物信息学分析.结果显示:本次试验克隆得到的PBoV重庆株NP1部分基因片段大小为257 bp,与已公布的PBoV-NP1基因的同源性为97.3%~100%;重庆株与PBoV瑞典株、PBoV中国株属同一进化分支,且PBoV重庆株NP1基因与PBoV瑞典株NP1基因亲缘性非常接近;PBoV重庆株NP1基因与GenBank公布的猪PBoV-NP1和1个人HBoV st1聚在博卡病毒一大分支,与PPV分属两大分支,而HBoVst1株又单独形成另一簇.这表明,PBoV重庆毒株与国外毒株的亲缘性非常接近,推测重庆地区猪群中感染的PBoV可能是通过引进或者进口国外动物性产品而传播感染猪群.
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文献信息
篇名
猪博卡病毒(重庆株)NP1部分基因的克隆测序及生物信息学分析
来源期刊
中国兽医杂志
学科
关键词
猪博卡病毒
NP1基因
克隆
生物信息学
年,卷(期)
2015,(1)
所属期刊栏目
调查研究
研究方向
页码范围
14-16
页数
3页
分类号
S852.65
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
聂奎
西南大学动物科技学院
87
471
12.0
15.0
2
叶星宇
西南大学动物科技学院
3
15
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6
聂福平
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猪博卡病毒
NP1基因
克隆
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国兽医杂志
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0529-6005
CN:
11-2471/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1953-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
12894
总下载数(次)
0
总被引数(次)
54031
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