BioSunLAMP:一个用于环介导等温扩增的引物设计软件

• 作者: 应晓敏 徐东刚 曹源 李伍举 查磊 蔡欣
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 工学
• 关键词: BioSunLAMP LAMP 引物设计
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 技术方法
• 页码范围: 230-233
• 分类号: TF31
• 字数: 2108字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-9960.2012.03.017

摘要

目的 环介导等温扩增法(1oop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种新型等温核酸扩增方法.由于其具有简便、高效、特异性高和成本低等优点,在甲型HlNl流感和肺结核等流行病检测中得到了广泛应用.在LAMP技术中,关键的起始步骤是设计合适的引物序列.为了让引物设计更加方便与高效,我们开发了LAMP引物设计软件BioSunLAMP.方法 采用Delphi程序设计语言开发了界面友好、便于使用的软件系统.结果 经甲型HlNl流感、结核分枝杆茵实验验证,BioSunLAMP软件设计的引物达到了预期效果.此外,与同类软件相比,BioSunLAMP还具有如下特点:①集引物设计与引物特异性分析于一体,可以通过本地数据库或远程调用NCBI的相关数据库来检查引物特异性;②支持针对多序列的通用引物与特异引物设计.结论 BioSunLAMP软件的开发,为LAMP技术的普及提供了很好的生物信息学支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡欣	军事医学科学院基础医学研究所	22	80	6.0	7.0
2	徐东刚	军事医学科学院基础医学研究所	75	421	10.0	17.0
3	李伍举	军事医学科学院基础医学研究所	19	164	5.0	12.0
4	应晓敏	军事医学科学院基础医学研究所	14	100	3.0	9.0
5	曹源	济南军区总医院实验诊断科	17	29	3.0	4.0
6	查磊	军事医学科学院基础医学研究所	5	13	2.0	3.0