鸡miR-18la组织的表达谱及其转录调控区域

• 作者: 孙桂荣 康相涛 李国喜 李明 田亚东 白义春 韩瑞丽
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 miR-181a 转录起始位点
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 1826-1832
• 分类号: S865.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.09.018

摘要

[目的]分析鸡miR-18la的转录起始位点,并分析其在1日龄和成年鸡不同组织中的表达谱,以期为研究miR-181a的功能奠定基础.[方法]采用qPCR技术构建miR-181a在1日龄和成年鸡肝脏、脾脏、肺、小肠、大脑、小脑、下丘脑、脑干、胸腺、心脏和肾脏组织中的表达谱.用version(1.83)分析miR-181a的保守性,并采用ENCODE数据库进行miR-181a转录起始位点和启动子区域的分析.[结果]①采用qPCR检测miR-181a在鸡下丘脑中的表达量和高通量测序的结果一致,1日龄下丘脑中的表达量显著低于成年鸡的表达量(P＜0.05)；②miR-181a在11个组织中均有表达,且在1日龄和成年鸡脾脏、肺、小肠、大脑、小脑、下丘脑、脑干、胸腺、心脏和肾脏组织的表达量差异显著(P＜0.05),而在肝脏中表达量的差异不显著(P＞0.05)；③miR-181a的前体miR-181a-1上游区域有一个启动子区和一个潜在的转录起始位点；④miR-181a-1的转录调控区域内存在的多个转录因子,转录因子主要有NFKB,c-Fos等.[结论]鸡miR-181a的表达有组织和时序差异,其成熟序列在脊椎动物中十分保守,上游有一个转录起始位点及启动子区.