鸡下丘脑高丰度miR-101的组织表达谱与功能预测分析

• 作者: 孙桂荣 康相涛 李国喜 王乐乐
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: miR-101 组织表达谱 靶基因 GO富集分析 鸡
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 1247-1255
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.06.019

摘要

[目的]全面了解鸡下丘脑高丰度miR-101的组织表达情况和潜在生物学功能,为揭示下丘脑调控鸡机体能量平衡的分子机制奠定基础.[方法]采用茎-环定量RT-PCR方法检测miR-101在固始鸡4个发育阶段、1 3种组织中的表达,利用Pictar算法预测miR-101的靶基因并对预测靶基因分别进行Gene Ontology分析、通路分析和分层富集.[结果]miR-101的表达具有明显的时序特征和组织特异性,胚胎期各组织中的表达水平明显高于出壳后,脑部各组织中的表达水平明显高于其它被检测的组织,并在14胚龄下丘脑以及17胚龄小肠和腿肌中高丰度富集；miR-101的预测靶基因在生物学调节、代谢过程、发育过程和细胞过程等基本生物学过程中显著富集；针对神经系统发育的生物信息学分析显示,miR-101调控功能主要涉及脑发育、神经元分化、神经发生调节、神经胶质细胞分化和星形胶质细胞分化等生物学过程.[结论]miR-101为脑部组织高丰度表达miRNA,在脑发育相关的许多生物学过程中可能发挥重要的调节作用.