鸡下丘脑高丰度差异性表达let-7a的组织表达谱及其功能分析

• 作者: 孙桂荣 康相涛 张锁 李国喜 王乐乐
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 鸡 let-7a 组织表达谱 功能预测
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 313-319
• 页数: 7页
• 字数: 5074字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2013.03.008

摘要

前期对固始鸡1日龄和36周龄下丘脑miRNA的Solexa测序分析表明,let-7a为鸡(Gallus domesticus)下丘脑发育过程高丰度差异性表达miRNA.为全面了解鸡let-7a的功能,采用实时定量PCR检测了1日龄和36周龄固始鸡两个发育阶段13种组织中let-7a的表达情况.结果表明:let-7a在所检测的组织中呈广泛性表达,其在下丘脑中的表达趋势与高通量测序结果一致；1日龄时,let-7a在下丘脑和肾脏中高丰度表达,在肺中低丰度表达,其他组织中适度表达；36周龄时,let-7a在各组织中的表达量都较低,除了在肺中的表达量较1日龄上升外,其余各组织的表达量都下降.同时,采用两种算法预测了let-7a的靶基因,并对107个共有靶基因进行了基因本体功能(Go)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,结果显示:靶基因主要在生物学过程调节相关的生物学过程中富集,尤其是与矿物质和磷代谢相关的调节过程；且在粘着斑、细胞外基质受体互作、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等3个通路中显著富集(P＜0.01).这些结果为进一步研究let-7a功能提供了有益线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	康相涛	河南农业大学牧医工程学院	197	1360	17.0	27.0
3	孙桂荣	河南农业大学牧医工程学院	102	567	12.0	17.0
4	李国喜	河南农业大学牧医工程学院	64	480	11.0	20.0
7	王乐乐	河南农业大学牧医工程学院	5	4	1.0	1.0
8	张锁	河南农业大学牧医工程学院	1	1	1.0	1.0