2011年猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析

• 作者: 冯力 刘孝珍 刘胜旺 张鑫 时洪艳 石达 陈建飞
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 遗传变异 S1基因
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 180-183
• 分类号: S852.65
• 字数: 2574字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.2012.03.04

摘要

为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成2对扩增S1基因的引物,利用套式RT-PCR方法,对2011年分离的17个PEDV S1基因进行扩增、克隆和序列测定；并将其进行比对和遗传演化分析.结果表明:17个PEDV S1基因序列与参考病毒株S1基因核苷酸序列同源性为90.54 ％～99.96％,与经典病毒株CV777相比,其中有6个S1基因在453 bp～454 bp处存在3个核苷酸的缺失；一个在453 bp～454 bp处缺失6个核苷酸；其它10个S1基因在173 bp～186 bp之间存在12个核苷酸的插入,413 bp～417 bp之间有3个核苷酸的插入,467 bp～468 bp处缺失6个核苷酸,插入和缺失位点与韩国病毒株KNU-0901、KNU-0905、KNU-0801相似.S1基因系统进化树分析表明,PEDV S1基因分为3群,其中7个S1基因属于PEDV Ⅰ群,另外10个属于PEDV Ⅲ群.