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2株乙型脑炎病毒的E基因的克隆与序列分析
2株乙型脑炎病毒的E基因的克隆与序列分析
作者:
文心田
曹三杰
王伟杰
袁磊
贾静
黄小波
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
乙型脑炎病毒
E基因
氨基酸序列
遗传进化分析
摘要:
目的 对2009年分离自四川省崇州与内江地区的2株乙型脑炎病毒的E基因进行序列测定与分析,了解其序列特征与遗传变异情况.方法 采集猪场流产死胎脑组织与蚊虫样品12份,用BHK-21细胞分离培养出2株乙型脑炎病毒,命名为JEV-CZ1株和JEV-NJ1株.针对乙脑疫苗株SA14-14-2基因组252-2509区段设计1对引物,扩增出分离株主要抗原基因E基因并测序,与不同国家及地区的乙脑毒株进行E基因核酸序列及推导氨基酸序列的同源性比较与进化树分析.结果 测序分析的E蛋白基因片段长1 500 bp,编码500个氨基端残基.JEV-CZ1株与广泛使用的减毒疫苗株SA14-14-2的E基因核酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为87.6%和97.2%,JEV-NJ1株与SA14-14-2株的E基因核酸与氨基酸序列的同源性分别为99.5%与99.2%.JEV-CZ1株与疫苗株SA14-14-2株在E蛋白3个结构域中有15个氨基酸的差异,JEV-NJ1株有3处差异.其中JEV-CZ1株在E138位的氨基酸为Glu,符合强毒特征.通过基因遗传进化分型显示,JEV-CZ1株为基因Ⅰ型,JEV-NJ1株为基因Ⅲ型,且2株病毒与以往四川分离的毒株遗传关系较近.结论 此次研究的分离株具有较强的地域性,遗传变异不大,且与疫苗株有较高的同源性.
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E基因
克隆
表达
广西猪瘟病毒E2基因克隆及序列分析
猪瘟病毒
E2基因
序列分析
同源性
氨基酸变异
广西
内容分析
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文献信息
篇名
2株乙型脑炎病毒的E基因的克隆与序列分析
来源期刊
中国人兽共患病学报
学科
医学
关键词
乙型脑炎病毒
E基因
氨基酸序列
遗传进化分析
年,卷(期)
2012,(4)
所属期刊栏目
实验研究
研究方向
页码范围
338-342
页数
分类号
R512.32
字数
4042字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1002-2694.2012.04.007
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
文心田
四川农业大学动物医学院
100
612
14.0
19.0
10
曹三杰
四川农业大学动物医学院
89
524
12.0
17.0
11
黄小波
四川农业大学动物医学院
52
188
9.0
11.0
15
袁磊
四川农业大学动物医学院
6
1
1.0
1.0
16
王伟杰
四川农业大学动物医学院
1
1
1.0
1.0
17
贾静
四川农业大学动物医学院
3
4
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乙型脑炎病毒
E基因
氨基酸序列
遗传进化分析
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研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
中国人兽共患病学报
主办单位:
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-2694
CN:
35-1284/R
开本:
大16开
出版地:
福建省福州市津泰路76号
邮发代号:
34-46
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
6893
总下载数(次)
10
总被引数(次)
38474
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中国人兽共患病学报1999
中国人兽共患病学报1998
中国人兽共患病学报2012年第9期
中国人兽共患病学报2012年第8期
中国人兽共患病学报2012年第7期
中国人兽共患病学报2012年第6期
中国人兽共患病学报2012年第5期
中国人兽共患病学报2012年第4期
中国人兽共患病学报2012年第3期
中国人兽共患病学报2012年第2期
中国人兽共患病学报2012年第12期
中国人兽共患病学报2012年第11期
中国人兽共患病学报2012年第10期
中国人兽共患病学报2012年第1期
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