虾夷马粪海胆溶菌酶基因SNP标记的开发及多态性分析

• 作者: 丁君 丛晓霏 常亚青
• 来源期刊: 中国农业科技导报
• 学科: 生物学
• 关键词: 虾夷马粪海胆 溶菌酶 高分辨率熔解曲线分析 SNP
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 海洋农业
• 页码范围: 136-144
• 分类号: Q959.268.3
• 字数: 7014字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0864.2012.05.21

摘要

采用高分辨率熔解曲线分析技术(HRM)对虾夷马粪海胆溶菌酶基因进行突变扫描,筛选出26个SNP候选位点.其中,碱基置换类型位点16个,占位点总数的61.54％;碱基插入或缺失的位点6个,缺失的碱基数为l～4个不等,占位点总数的23.08％;碱基置换类型模糊以及三态位点4个,占位点总数的15.38％.SNP在虾夷马粪海胆溶菌酶基因的cDNA中的分布频率约为2.85％,位于编码区的位点有18个,其中2个为错义突变.应用小扩增子基因分型法对5个SNP位点在2个不同地域群体的60个样本中进行分型分析,结果显示:5个SNP位点均含有2个等位基因,次等位基因频率分布范围为0.150 0 ～0.500 0,位点S1Lyz-7、SILyz-15和SILyz-20在两个群体间的次等位基因频率相差较大.研究结果表明,HRM是一种高效便捷的SNP分析方法,所筛选出的SNP标记可用于虾夷马粪海胆遗传育种的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丁君	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	47	394	13.0	17.0
2	常亚青	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	142	766	15.0	19.0
3	丛晓霏	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	2	1	1.0	1.0