红麻EST-SSR标记的开发及其多态性评价

• 作者: 万雪贝 李东旭 徐益 徐建堂 张力岚 张列梅 林荔辉 祁建民 张立武
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 红麻 SSR 遗传多样性 标记开发
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1170-1180
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2017.01170

摘要

红麻是最重要的自然纤维作物之一，然而SSR标记的匮乏限制了其遗传改良。本研究从红麻90175个EST序列中挑出含有转录因子的EST，开发了94对SSR引物。以24份不同红麻种质资源的DNA为模板，利用9%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测多态性。结果表明，85对引物(占90.4%)至少在2个材料之间存在多态性，表明开发的EST-SSR具有很好的多态性。其中，三核苷酸重复所占比例最多，重复基元AAT和ATG的多态性较高。聚类分析表明，24份红麻种质资源的遗传相似系数变化在0.62~0.92之间，表现出丰富的遗传基础。这些结果不仅丰富了红麻的分子标记数量，而且为红麻的遗传分析提供资源。