辣椒多态性EST-SSR标记开发及连锁图谱构建

• 作者: 刘峰 欧阳娴 王运生 谢玲玲 邹学校
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 多态性 连锁图谱 表达序列标签技术 简单重复序列
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺·园林
• 页码范围: 162-167
• 分类号: S641.3
• 字数: 5214字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1238.2012.00162

摘要

采用SSR检索程序,从辣椒221 037条unigenes中筛选到17 319个SSR位点,设计了10 468对引物,并对其进行E-PCR多态性检测.结果表明,1 538对引物具有多态性,其中554条辣椒EST序列能匹配到番茄基因组上,构成了12条辣椒EST-SSR连锁群,平均每条连锁群含45.75个EST-SSR.对匹配到番茄基因组上的EST-SSR进行GO(gene ontology)分类,结果有481条EST序列被分类,其中以初生代谢、细胞代谢、生物合成过程为主,分别占34.13％、28.35％、25.82％.在KEGG map中,91条EST序列共涉及到76条代谢途径(KEGG),约67条序列参与新陈代谢途径,32条序列参与次生代谢产物合成途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘峰	湖南省农业科学院蔬菜研究所	58	275	9.0	14.0
5	谢玲玲	湖南省农业科学院西瓜甜瓜研究所	14	39	4.0	5.0
6	欧阳娴	湖南省农业科学院蔬菜研究所	8	16	3.0	3.0
7	王运生	湖南农业大学生物安全科学技术学院	21	661	8.0	21.0
11	邹学校	湖南省农业科学院蔬菜研究所	78	907	18.0	27.0