辣椒EST-SSR标记的开发与应用

• 作者: 刘伟强 吴智明 唐鑫 崔竣杰 程蛟文 胡开林
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 EST-SSR 标记开发
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 171-174
• 分类号: S641.3
• 字数: 3194字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-411X.2012.02.011

摘要

通过对数据库中32 295条非冗余的辣椒EST序列进行搜索,发现3 396个SSR分布于3 277条EST序列中,EST-SSR频率为10.52％,平均分布距离为4.46 kb.在辣椒EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占总SSR的43.02％和37.84％.优势重复基元为GA/TC、AG/CT和AT,分别占15.99％、11.98％和11.37％.用Primer Premier 5.0软件设计了420对引物,对辣椒抗疫病自交系‘B072’和感疫病自交系‘B088’进行PCR扩增,403对引物有扩增产物,引物有效扩增率为95.96％,其中76对引物有多态性,多态性引物占可扩增引物的18.86％.试验证明,利用辣椒EST序列开发SSR标记是可行的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘伟强	华南农业大学园艺学院	38	115	6.0	8.0
2	胡开林	华南农业大学园艺学院	39	461	13.0	20.0
3	吴智明	仲恺农业工程学院园艺园林学院	25	135	7.0	10.0
4	唐鑫	华南农业大学园艺学院	7	73	5.0	7.0
5	程蛟文	华南农业大学园艺学院	15	75	5.0	8.0
6	崔竣杰	华南农业大学园艺学院	6	42	3.0	6.0