鸟巢蕨EST-SSR标记的开发与应用

• 作者: 孙晓波 梁丽建 贾新平 邓衍明
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸟巢蕨 分子标记 EST-SSR
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 页码范围: 134-139
• 页数: 6页
• 分类号: S682.03
• 字数: 4071字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2015.06.020

摘要

为加速分子标记在鸟巢蕨研究中的应用,利用鸟巢蕨EST序列开展了EST-SSR标记的开发和应用研究.利用MISA软件对鸟巢蕨EST序列进行SSR位点查找,分析EST-SSR的总体特征,并利用Primer 3.0软件设计40对引物,选用10份蕨类材料检测引物的多态性.从42 907条鸟巢蕨EST序列中检测到6 067个SSR位点,其出现频率为1/6.62 kb,包括106种重复基元.在鸟巢蕨EST-SSR中,二核苷酸重复(2 873个,47.35％)是最主要的类型,其次是三核苷酸(1 107个,18.25％)和单核苷酸(972个,16.02％).出现最多的重复基元是AG/TC(1 371个,22.60％),其次是CA/GT(1 066个,17.57％)和A/T(628个,10.35％).设计合成了40对EST-SSR引物对10份蕨类材料进行PCR扩增,26对引物能扩增出明显条带,其中17对引物扩增出了65条多态性条带,平均每对引物多态性带为3.82条.遗传分析表明,10份蕨类材料之间的遗传相似系数为0.338～0.815,可将供试蕨类材料分为2个类群.从鸟巢蕨EST序列中开发SSR标记是有效和可行的,开发的EST-SSR引物可用于蕨类植物遗传分析研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓衍明	江苏省农业科学院园艺研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室	21	242	7.0	15.0
2	孙晓波	江苏省农业科学院园艺研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室	22	202	6.0	13.0
3	梁丽建	江苏省农业科学院园艺研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室	18	162	5.0	12.0
4	贾新平	江苏省农业科学院园艺研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室	21	171	5.0	12.0