基于EST-SSR标记甘薯连锁图谱构建及淀粉性状的QTL定位

• 作者: 傅体华 吕长文 唐道彬 张凯 王季春 谢德斌
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 甘薯 淀粉含量 EST-SSR 连锁图谱 数量性状
• 年，卷（期）: 2016,（23）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 4488-4506
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2016.23.003

摘要

[目的]利用分子标记技术,构建甘薯遗传连锁图谱,并分析甘薯淀粉含量性状的QTL位点,为高淀粉含量甘薯种质资源利用及甘薯分子标记辅助育种提供理论和实践依据.[方法]以高淀粉含量品种万薯5号为母本、低淀粉含量品种商丘52-7为父本建立杂交群体,利用EST-SSR标记,采用“双假测交”策略和运用JoinMap4.0软件,分别构建双亲遗传连锁图谱,并结合F1(201 2、201 3年)群体表型数据采用区间作图法对淀粉含量性状进行QTL检测.[结果]利用1 679对EST-SSR引物筛选出的1 045对多态性引物检测F1群体的标记基因型,获得了1 418个标记位点.分别对上述获得的父母本多态性标记进行遗传连锁分析,在LOD≥5.0情况下,分别构建父母本的连锁遗传图谱.采用642个标记的多态性位点构建母本连锁群74个,其中,21 5个标记位点位于连锁图谱上,占标记多态性位点总数的33.5％.每个连锁群上有2-11个标记位点,连锁群长度在0.6-129.4 cM,图谱总长为3 826.07 cM,标记间平均距离为17.80 cM.属于父本的776个标记位点构建了80个连锁群,共有252个标记位点构建在连锁图谱上,占标记总数的32.5％,每个连锁群上有2-24个标记位点,连锁群长度在2.0-156.8 cM,图谱总长为3 955.0 cM,标记间平均距离为15.7 cM.以F1杂交群体构建的遗传连锁图谱,结合2012年、201 3年2个环境,利用QTL作图软件MapQTL5.0,采用区间作图法进行分析,共检测到17个与淀粉含量性状相关的QTL,贡献率在8.4％-40.5％.其中qWsc-1、qWsc-2、qWsc-3 3个QTL位于母本万薯5号连锁群上,且在2年环境中均可检测到;14个QTL位于父本商丘52-7连锁群上,qSsc-1、qSsc-2、qSsc-3、qSsc-4、qSsc-8、qSsc-10、qSsc-11、qSsc-12是在2个环境均检测到的QTL.qSsc-5、qSsc-6、qSsc-7、qSsc-9、qSsc-1 3、qSsc-14是只在1个环境检测到的QTL.标记GDAAS0603在双亲中和2个环境中均同时检测到,这些环境稳定QTL可用于分子标记辅助选择.[结论]分别构建了亲本EST-SSR分子标记连锁群图谱,丰富了构建甘薯图谱的标记类型,定位了1 7个与淀粉含量相关的QTL位点.