利用EST-SSR标记评价羽扇豆属(Lupinus L.)遗传多样性

• 作者: 张红岩 杨涛 刘荣 晋芳 张力科 于海天 胡锦国 杨峰 王栋 何玉华 宗绪晓
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: EST-SSR 羽扇豆属 转录组 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 330-340
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2020.94077

摘要

利用基于窄叶羽扇豆转录组开发并筛选出的95对多态性EST-SSR标记, 对羽扇豆属的22个种133份资源进行全基因组扫描, 初步探究羽扇豆属下种间的进化关系, 分析来源于“旧世界”羽扇豆种间的遗传多样性, 为羽扇豆优异资源的挖掘和创新利用提供理论依据。结果表明, 用95对SSR标记共检测出1318个等位变异, 每对标记平均检测出3~37个等位变异, 平均为13.87个; 多态性信息量(PIC)变化范围0.39~0.91, 平均为0.75; 基因多样性变化范围0.41~0.92, 平均为0.78。基于邻接法(NJ)的系统发育初步探究了羽扇豆种间的进化关系, 22个羽扇豆种分别来源于“旧世界”和“新世界”, 与之前研究结果相对一致。聚类分析、群体结构分析和主成分分析结果均表明, 来源于“旧世界”的7个羽扇豆种被划分为4个组群, 各组群所包含的参试资源没有种间交叉重叠。