北京部分地区猪瘟病毒流行株E2基因序列分析

• 作者: 傅彩霞 吴惠明 李佳 王玉田 郑瑞峰 郭峰 陈立本 靳兴军
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪瘟病毒 E2基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 61-66
• 分类号: S852.651|Q785
• 字数: 4322字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2012.01.014

摘要

为了解北京地区猪瘟病毒(CSFV)流行毒株的遗传变异情况,采用套式RT-PCR方法,对从北京部分地区近期分离的7株CSFV流行毒株的E2基因主要抗原编码区进行了扩增、克隆与序列测定,并应用DNA Star分析软件对所测定的7株毒株与国内外参考毒株的相应序列进行了同源性分析及氨基酸序列比对.结果表明,7株CSFV流行毒株之间核苷酸与氨基酸的同源性分别为96.3％～99.3％和95.6％～100％,与CSFV石门毒株(Shimen株)的核苷酸与氨基酸的同源性分别为81.7％～83.5％和82.4％～84.6％,与CSFV兔化弱毒株(HCLV株)的核苷酸与氨基酸的同源性分别为80.6％～81.7％和78.0％～80.2％,7株CSFV流行毒株均属于基因2群,且705、713、729和734位氨基酸发生置换.本研究初步揭示了北京部分地区目前流行的CSFV毒株与Shimen株和HCLV株在E2基因主要抗原区上存在较大差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王玉田		50	103	5.0	7.0
2	李佳		5	26	3.0	5.0
3	傅彩霞		8	38	4.0	6.0
4	靳兴军		26	131	7.0	10.0
5	郑瑞峰		5	14	2.0	3.0
6	郭峰		9	72	5.0	8.0
7	吴惠明		3	9	1.0	3.0
8	陈立本		4	17	2.0	4.0