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摘要:
利用RACE技术克隆刺五加甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶(mevalonate diphosphate decarboxylase,MDD)基因的全长cDNA序列,运用生物信息学方法对该基因进行分析,并通过RT-PCR法检测MDD在刺五加不同生长发育时期和不同器官中的表达情况.结果表明:(1)刺五加MDD基因cDNA序列全长1 769 bp(GenBank登录号为JQ905594),开放阅读框全长1 263bp,编码420个氨基酸残基,包含GHMP激酶超家族的特异性识别序列;刺五加MDD蛋白的二级结构中含有161个α螺旋,占38.33%;68个延伸链,占16.19%;19个β折叠,占4.52%;172个无规则卷曲,占40.95%;刺五加MDD蛋白无跨膜区域,定位于膜外.(2)刺五加MDD基因在不同生长发育时期和器官中均有表达,但表达量具有显著差异(P<0.05).在整个生长期中,MDD的表达呈现高-低-高-低的变化趋势,第一个表达高峰出现在萌芽期至叶片完全展开时,第二个高峰出现在果实体积快速增长期,最高表达量(叶片完全展开期)为最低表达量(叶片衰老期)的4.51倍;不同器官中,幼茎的表达量最高,为最低表达量(叶片)的7.22倍,但叶片、叶柄和根中的表达量差异不显著.研究结果为阐明刺五加皂苷的生物合成及对其进行表达调控奠定了基础.
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文献信息
篇名 刺五加甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶基因的克隆与表达分析
来源期刊 西北植物学报 学科 生物学
关键词 刺五加 MDD基因 克隆 RT-PCR
年,卷(期) 2012,(10) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 1950-1956
页数 7页 分类号 Q785|Q786
字数 5302字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 邢朝斌 河北联合大学生命科学学院 56 376 11.0 16.0
2 何闪 河北联合大学生命科学学院 25 247 9.0 15.0
3 龙月红 河北联合大学生命科学学院 31 256 9.0 14.0
4 修乐山 河北联合大学生命科学学院 24 132 8.0 10.0
5 周秘 河北联合大学生命科学学院 16 78 6.0 8.0
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研究主题发展历程
节点文献
刺五加
MDD基因
克隆
RT-PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西北植物学报
月刊
1000-4025
61-1091/Q
大16开
陕西省杨陵邰城路3号西北农林科技大学
52-73
1980
chi
出版文献量(篇)
7739
总下载数(次)
9
总被引数(次)
145271
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
河北省自然科学基金
英文译名:
官方网址:
项目类型:
学科类型:
论文1v1指导