甘蔗S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因Sc-SAMDC3的克隆和表达分析

• 作者: 吴凯朝 文乐 曹辉庆 李楠 邓智年 魏源文 黄诚梅
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 甘蔗 S-腺苷蛋氨酸脱羧酶 Sc-SAMDC3 克隆 PEG胁迫
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 1931-1936
• 页数: 6页
• 分类号: S566.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2015.11.1931

摘要

[目的]同源克隆干旱胁迫诱导下甘蔗(Saccharum officinarum)S-腺苷蛋氨酸脱羧酶3(S-adenosylmethionineDecarboxylase 3,SAMDC3)基因主编码区(mORF),并进行生物学信息及其表达特性分析,为该基因遗传转化研究奠定基础.[方法]以甘蔗Sc-SAMDC3基因序列为模板设计引物,克隆Sc-SAMDC3基因mORF并使用相关软件进行序列分析.采用实时荧光定量PCR分析Sc-SAMDC3基因在PEG-6000胁迫下的表达特性.[结果]Sc-SAMDC3基因主编码区长度为1188 bp,编码395个氨基酸.氨基酸序列分析结果显示,甘蔗SAMDC3有β折叠16个、α螺旋6个、卷曲3个,盘曲或折叠形成三级结构,酶活性中心残基位点分别位于第77、92、243、256位氨基酸残基,标志片段的酶原加工位点和PEST结构域与高粱、玉米高度保守.在25％ PEG-6000胁迫2～24h期间,Sc-SAMDC3基因的表达随胁迫诱导时间的延长而呈上调表达;至24 h时,其表达量为对照的8.26倍.[结论]克隆获得的Sc-SAMDC3基因表达受PEG-6000胁迫强烈诱导,可能参与甘蔗对干旱逆境胁迫响应的代谢调控.