1对同卵双生新生儿DNA甲基化谱差异分析

• 作者: 丛斌 付丽红 关亚卿 张晓静 张贺玲 李淑瑾 马春玲
• 来源期刊: 中国法医学杂志
• 学科: 政治法律
• 关键词: 法医遗传学 DNA甲基化谱 甲基化免疫共沉淀 同卵双生子 高通量测序
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 技术交流
• 页码范围: 299-302
• 页数: 4页
• 分类号: DF795.2
• 字数: 3019字
• 语种: 中文

摘要

目的 探索1对同卵双生新生儿之间DNA甲基化谱的差异.方法 应用甲基化免疫共沉淀结合高通量测序法对1对同卵双生新生儿的DNA甲基化谱进行检测,分析基因组DNA甲基化特点及其之间的差异,筛选适用于法医学分析的甲基化位点.结果 两样本各获得7300万原始测序序列(raw reads)数据,与人类基因组参考序列比对,各得到4800万和5000万唯一比对reads,其中大部分分布在重复区域,且在Alu序列分布最为广泛.两样本DNA甲基化富集区域(peak)各检测到257 362条和197 272条,基因组覆盖率分别为6.53％和5.29％,分布在基因组不同区域,以中间内含子区含量最多.分析两样本甲基化差异区域得到2205条差异的甲基化序列,其中595条位于基因区域,1610条位于基因间区,从中筛选出113条序列,用于进一步深入研究其法医学应用价值.结论 本研究初步证实了DNA甲基化用于同卵双生子鉴定的可行性,为筛选同卵双生子DNA甲基化差异位点提供了基础数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	丛斌	河北医科大学法医学系	190	878	15.0	20.0
2	马春玲	河北医科大学法医学系河北省法医学重点实验室	54	254	9.0	13.0
3	李淑瑾	河北医科大学法医学系河北省法医学重点实验室	75	391	11.0	15.0
4	付丽红	河北医科大学法医学系河北省法医学重点实验室	20	57	5.0	7.0
5	张晓静	河北医科大学法医学系河北省法医学重点实验室	33	149	6.0	11.0
6	张贺玲		2	11	2.0	2.0
7	关亚卿	河北医科大学法医学系河北省法医学重点实验室	3	18	3.0	3.0