阴沟肠杆菌B8拮抗活性基因'admA'及上游调控序列的克隆与功能鉴定

• 作者: 余旭平 朱军莉 李德葆
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 阴沟肠杆菌B8 拮抗机理 Andrimid 染色体步移
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 495-502
• 分类号: S476.1
• 字数: 6514字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2012.00495

摘要

为了阐明水稻白叶枯病拮抗菌阴沟肠杆菌B8 的作用机理,文章采用转座子标签法和染色体步移技术克隆到突变株B8B 中Tn5 插入位点周边拮抗活性相关片段,并通过基因敲除验证了获得的拮抗相关片段-admA'上游调控序列的功能.以转座子中Kan 抗性基因为标签,克隆了B8B菌株中Tn5 插入位点左侧2 608 bp 序列,经两次染色体步移得到Tn5 插入位点右侧的2 354 bp 序列.序列拼接后获得B8 菌株拮抗相关序列4 611 bp 的Bcontig.生物信息学分析显示该序列含有7 个ORF,分别对应于3-磷酸甘油醛脱氢酶(GADPH)基因的部分编码区、2 个LysR 家族转录调控因子、弧菌假设蛋白VSWAT3-20465 及成团泛菌(Pantoea agglomerans) andrimid 生物合成基因簇的admA、admB 和部分admC 基因序列.B8B 菌株Tn5 插入分别位于同源于弧菌假设蛋白的anrPORF 及‘admA'基因上游200 bp 和894 bp 处.通过同源重组技术,借助敲除质粒pMB-BG,获得拮抗活性消失的突变株B-1 和B-3.结果表明B8B 突变株中Tn5 的插入可能影响了anrP 蛋白的转录和表达,进而调控拮抗物质编码基因簇的生物合成.B8 菌株中拮抗物质相关基因是类似于andrimid 生物合成基因簇的基因家族,其上游调控区对该抗生素的生物合成具有重要的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余旭平	浙江大学动物科学学院	67	501	12.0	18.0
2	李德葆	浙江大学生物技术研究所	76	2052	28.0	43.0
3	朱军莉	浙江大学动物科学学院	71	881	17.0	25.0