高粱甲基化连锁群A、B的构建及甲基化位点、甲基化模式的分析

• 作者: 孙毅 杨武德 段永红 王铭
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 高粱 SSR MSAP DNA甲基化
• 年，卷（期）: 2012,（18）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 3699-3708
• 分类号: S514
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.18.003

摘要

[目的]构建高粱甲基化连锁群A和B,并分析其上的甲基化位点分布及甲基化模式变化.[方法]从高粱品种强优势组合B2V4×1383-2杂交组合获得的F2分离群体(共150个体)为材料,以SSR标记为锚定标记,采用SSR和MSAP标记技术,并用Mapmaker/Exp (Version 3.0)和Map/Draw 2.1软件进行分析.[结果]构建出高粱甲基化连锁群A-a和A-b及甲基化连锁群B-a和B-b,其中,甲基化连锁群A覆盖高粱基因组93.7 cM,包含10个SSR标记、20个MSAP标记,甲基化连锁群B覆盖高粱基因组90.4 cM,包含4个SSR标记、39个MSAP标记；连锁群A-a上甲基化位点仅来源于EcoRⅠ /Msp Ⅰ酶切组合,而其它连锁群上甲基化位点来源于EcoRⅠ /MspⅠ和EcoR Ⅰ/Hps Ⅱ 2种酶切组合；甲基化连锁群A-b和B-b上各存在一个稍密集的甲基化位点区域,而连锁群B-a上存在一个较密集的甲基化位点区域；基于同一酶切的高粱亲本间有多态性差异,F2群体存在分离,高粱亲本与杂交种F1的甲基化模式有2种类型的变化.[结论]MSAP标记可以检测到大量的甲基化差异片段,结合锚定的SSR标记,能够有效地构建植物基因组的甲基化遗传连锁群或遗传连锁图谱；在连锁群上检测到3个密集的甲基化位点区域,分别位于SSR标记Xtxp 302、Xtxp 96及Xtxp 304附近；在获得的连锁群中,发生去甲基化反应的甲基化位点数高于甲基化水平提高的位点数.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨武德	山西农业大学农学院	97	1082	19.0	29.0
2	段永红	山西农业大学农学院	52	412	9.0	19.0
4	孙毅	山西省农业科学院生物技术研究中心	143	2581	25.0	44.0
10	王铭	山西省农业科学院生物技术研究中心	14	49	4.0	6.0