北京地区实验动物绿脓杆菌分离株MLVA分型

• 作者: 吴军 岳秉飞 贺争鸣 邢进
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 绿脓杆菌 多位点可变数目串联重复序列 基因分型 实验动物
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 44-50,后插9
• 分类号: R-332
• 字数: 3154字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671.7856.2012.005.010

摘要

目的 通过多位点可变数目串联重复序列分析(multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis,MLVA)分型方法,研究北京地区实验动物绿脓杆菌分离株基因型和分布情况.方法 选择13个可变数目重复序列(variable-number tandem-repeat,VNTR)位点,对实验动物及设施中检测出的141株绿脓杆菌的基因组DNA进行重复序列扩增,所得指纹图谱使用BioNumerics软件进行聚类分析,绘制系统发育树和最小生成树(minimum spanning tree,MST).结果 所采用的13个VNTR位点能够对全部分离株进行有效分型.141株绿脓杆菌主要被分为了3个基因群,56个基因型.各群所占比例分别为A群82.3％,B群占12.8％,C群占5.0％,辛普森多样性指数为0.763.同一区域内相邻实验动物单位的绿脓杆菌分离株同源关系较远.结论 MLVA方法对绿脓杆菌具有很好的分型能力,能够有效的追踪绿脓杆菌的来源.北京地区实验动物中绿脓杆菌分离株基因型多态性丰富,但无地域性同源关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	岳秉飞	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	117	385	11.0	14.0
2	贺争鸣	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	100	337	9.0	14.0
3	吴军	军事医学科学院生物工程研究所	55	227	8.0	13.0
4	邢进	军事医学科学院生物工程研究所	40	208	8.0	13.0