16个高丛越橘品种VcCBF基因的单核苷酸多态性(SNP)分析

• 作者: 刘庆忠 姜超 林科 王甲威 魏海蓉
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: CBF 单核苷酸多态性(SNP) 越橘
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 页码范围: 41-44
• 分类号: S663.9
• 字数: 2228字
• 语种: 中文

摘要

CBF是与植物抗寒、抗旱等抗逆性相关的一种转录因子,在植物抵抗逆境过程中发挥重要作用.以16个高丛越橘品种为试材,采用直接测序法克隆VcCBF基因,共克隆到94个非重复序列,对这些序列进行单核苷酸多态性分析,测序总长度63732 bp,共发现103个SNP,单核苷酸多态性发生频率为1/619 bp,核苷酸多态性值(Pi)为0.01274.在103个SNP中,单态突变位点为52个,简约信息位点为51个,其中双突变为50个,三态突变为1个.通过碱基转换方式的分析发现,转换共83个,颠换19个,转换与颠换的发生比率为4.37??1.通过单倍型分析发现在16个越橘品种中VcCBF基因存在5种单倍型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘庆忠	山东省果树研究所山东省果树生物技术育种重点实验室	192	2971	28.0	45.0
2	魏海蓉	山东省果树研究所山东省果树生物技术育种重点实验室	59	564	14.0	20.0
3	王甲威	山东省果树研究所山东省果树生物技术育种重点实验室	33	179	10.0	11.0
4	林科	泰山学院生物与酿酒工程学院	7	32	4.0	5.0
5	姜超	泰山学院生物与酿酒工程学院	1	4	1.0	1.0