豫陕两省14株鸡杆菌的gyrB、16S rRNA和rpoB基因序列比较分析

• 作者: 刘红英 常洪涛 李乔晶 杨霞 王川庆 王新卫 皇甫和平 赵军 陈陆
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡杆菌 鸭源鸡杆菌 16S rRNA rpoB gyrB 进化分析
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 1103-1110
• 分类号: S852.612
• 字数: 4003字
• 语种: 中文

摘要

分析河南、陕西分离的14株鸡杆菌(Gallibacterium)之间的进化关系,及gyrB基因序列比较在该菌进化分析中的作用.PCR扩增鸡杆菌分离株的gyrB、16S rRNA和rpoB 3个看家基因,PCR产物纯化后直接测序.将鸡杆菌分离株、国外参考株的3个看家基因序列进行比较分析,用Phylip 3.67软件构建进化树.结果表明,14株鸡杆菌与鸭源鸡杆菌(Gallibacterium anatis)模式株间的相似性为96.3％～98.0％(gyrB)、97.7％～99.6％(16SrRNA)和97.7％～99.0％(rpoB);14株鸡杆菌与鸡杆菌复合群1(Gallibacterium genomosp.1)参考株间的相似性为88.8％～89.9％(gyrB)、96.2％～97.5％(16S rRNA)和92.6％～93.6％(rpoB).基于3个看家基因序列的进化分析,均显示14株鸡杆菌和鸭源鸡杆菌模式株形成单独的一个群.14株鸡杆菌分离株均属于鸭源鸡杆菌种；在3个看家基因位点,鸡杆菌河南株与陕西株之间、鸡杆菌输卵管炎病鸡分离株与健康鸡分离株之间均无明显遗传上的差异；gyrB基因序列分析可用于鸡杆菌分离株的种类鉴定,且对14株鸡杆菌与复合群1参考株的区别能力优于另外2个看家基因.