鸭RIG-1基因的PCR扩增及其序列分析

• 作者: 廖明 廖顺娣 焦培荣 程玉强 罗开健 袁润余 贾宝琴 钟自富 韦良孟
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭 维甲酸诱导基因1 聚合酶链反应 序列分析 天然免疫
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 15-21
• 分类号: Q343.1|S858.32
• 字数: 4328字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2012.06.004

摘要

维甲酸诱导基因1 (RIG-1)是细胞质中侦测病原相关分子模式的识别受体.论文旨在扩增北京鸭RIG-1编码基因,并对其进行序列分析.通过PCR方法,从北京鸭脾脏中扩增得到RIG-1基因cDNA,并使用LaserGene分子生物学分析软件进行序列分析.结果发现北京鸭的RIG-1基因cDNA开放阅读框全长2 802 bp,编码933个氨基酸.结构预测发现鸭RIG-1结构与哺乳动物类似,N端有两个串联CARD区,中间为DExD/H解旋酶区,C端为抑制区,各功能区起重要作用的氨基酸较为保守.同源性及进化树分析发现鸭RIG-1与鹅和斑马鱼的同源性最高分别为93.7％、78.4％,与哺乳动物同源性高于50％,与其他鱼类的同源性低于50％.成功扩增出北京鸭RIG-1基因cDNA编码序列,为鸭RIG-1的深入研究奠定了基础.