Biolog和PCR-DGGE技术解析椒江口沉积物微生物多样性

• 作者: 刘晶晶 寿鹿 廖一波 曾江宁 杜萍 沈李东 胡宝兰 陈全震
• 来源期刊: 环境科学学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: Biolog PCR-DGGE 椒江口沉积物 微生物代谢功能 细菌群落结构 多样性
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1436-1444
• 分类号: X171
• 语种: 中文

摘要

采用Biolog和PCR-GGE技术对椒江口6个站位表层沉积物群落水平的微生物代谢功能和以16SrRNA基因标记的细菌遗传多样性进行分析，并对其代谢功能和群落结构与沉积物污染物等参数进行冗余梯度分析（Redundancygradientanalysis，RDA）和典范对应分析（Canonicalcorrespondenceanalysis，CCA）．Biolog分析结果表明，微生物群落整体代谢活性由高到低的顺序为：潮问带（B1、B2）、人海口处（A3）〉人海口内（A1、A2）〉人海口外（A4）；碳源代谢的Shannon-Wiener多样性指数范围为2．09-3．25，由高到低的顺序为：潮间带（B1、B2）、人海口处（A3）〉河道内（A1）〉近人海口处（A2）〉人海口外（A4）；潮间带、人海口处及河道内的微生物对各类碳源的相对利用率较平均，而近人海口处和人海口外的微生物群落对聚合物的相对利用率较高，对氨基酸类和胺类的相对利用率较低．DGGE图谱分析表明，细菌群落结构沿河口盐度梯度存在空间异质性，但两潮间带站位的相似度高（82．27％）；遗传基因的Shannon-Wiener多样性指数范围为1．68-2．87，由高到低的顺序为：潮间带〉人海口处〉人海口外〉近入海口处〉河道内．群落代谢功能与理化因子的RDA显示，有机质和硝基苯的分布能较好地解释微生物群落代谢功能的变化；群落遗传结构与理化因子的CCA显示，硝基苯和多环芳烃的分布能较好地解释细菌群落遗传结构的变化．综上结果认为，椒江口沉积物的微生物代谢及遗传多样性符合典型的河口特征，但人海口内微生物沉积环境已表现出对某些化工污染物的响应．