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鹌鹑VIPR-1的克隆、序列特征和组织表达分析
鹌鹑VIPR-1的克隆、序列特征和组织表达分析
作者:
周敏
张成广
张细权
徐海平
李莹
沈栩
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
鹌鹑
血管活性肠肽1型受体基因
分子特征
组织表达分析
摘要:
[目的]对鹌鹑血管活性肠肽1型受体(vasoacitve intestinal peptide type 1 receptor,VIPR-1)cDNA全长基因进行克隆及分析,为鹌鹑的分子育种提供基础资料.[方法]通过比较基因组学,采用RT-PCR和RACE技术,获得鹌鹑了VIPR-1 cDNA全长序列;通过生物学软件对其核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对;采用实时定量PCR方法检测了VIPR-1在8个组织中的表达.[结果]鹌鹑VIPR-1的cDNA全长2 427 bp,包含了1 341 bp的开放性阅读框,编码446个氨基酸;序列分析显示,克隆获得的鹌鹑VIPR-1编码区序列与鸡该编码区序列存在41个碱基的差异,造成4个氨基酸残基的不同;VIPR-1氨基酸序列与鸡、火鸡、斑胸草雀的氨基酸的一致性分别为99.1%、92.2%、88%,与其它物种的一致性在60%-78%;各物种VIPR-1蛋白进化树符合物种进化规律;VIPR-1理化性质表明该蛋白为一偏碱性蛋白,蛋白二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和β-转角构成;在N-端存在一个由22个氨基酸残基(MKSARLRVLLPLLGCLLSAASS)组成的信号肽,7个α-螺旋构成的跨膜域和C-端结构域,在跨膜域有胆固醇结合位点;在所检测的8个组织中VIPR-1 mRNA均有表达,在小肠中表达量最高.[结论]成功地克隆了鹌鹑VIPR-1 cDNA全长序列,该基因在小肠组织的表达高于其它组织,在跨膜域存在胆固醇结合位点.
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内容分析
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(/年)
文献信息
篇名
鹌鹑VIPR-1的克隆、序列特征和组织表达分析
来源期刊
中国农业科学
学科
农学
关键词
鹌鹑
血管活性肠肽1型受体基因
分子特征
组织表达分析
年,卷(期)
2012,(3)
所属期刊栏目
畜牧·资源昆虫
研究方向
页码范围
529-539
页数
分类号
S839
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2012.03.015
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
周敏
江西教育学院生物技术研究所
12
112
7.0
10.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
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节点文献
鹌鹑
血管活性肠肽1型受体基因
分子特征
组织表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
江西省自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Jiangxi Province
官方网址:
http://www.jxstc.gov.cn/ReadNews.asp?NewsID=861
项目类型:
学科类型:
期刊文献
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