鸽PPARγ基因的克隆、序列分析及组织表达特征

• 作者: 卢立志 曾涛 李国勤 沈军达 田勇 钟声亮 陈黎 陶争荣
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸽 过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ) 克隆 序列分析 组织表达
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 628-638
• 页数: 11页
• 分类号: S836
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.04.013

摘要

过氧化物酶体增殖物激活受体γ (peroxisome proliferator activated receptor γ,PPARγ)是一种由配体激活的核转录因子,在脂类代谢调控中发挥重要作用.本研究旨在克隆鸽(Columba livia) PPARγ基因的全长cDNA序列,并分析该基因编码的蛋白质理化性质和结构特征,揭示其组织表达特征.以鸽脾脏组织总RNA为模板,采用快速扩增cDNA末端(rapid amplification cDNA ends,RACE)方法,克隆到PPARγ基因的cDNA序列,并运用生物信息学的方法对其进行分析,运用实时荧光定量PCR检测PPARγ基因在鸽心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏和肌肉组织中的表达情况.研究结果表明,鸽PPARγ基因(GenBank No.KU166859.2) cDNA全长1 846 bp,包含1 428 bp的开放阅读框,63 bp的5’端非编码区和355 bp的3’端非编码区,共编码475个氨基酸.经预测,鸽PPARγ基因编码的蛋白质由7 661个原子组成,分子式为C2436H3840N644O714S27,等电点为6.19,相对分子质量为54.438 79 kD,平均亲水性为-0.287.结构预测表明,鸽PPARγ蛋白具有2个锌指结构以及配体结合域.鸽PPARγ氨基酸序列与杜鹃(Cuculus canorus)、鸭(Anas platyrhynchos)、鹦鹉(Melopsittacus undulates)、斑胸草雀(Taeniopygia guttata)、火鸡(Meleagris gallopavo)、鸡(Gallus gallus)、鹌鹑(Coturnix japonica)、猪(Sus scrofa)、人(Homo sapien)、小鼠(Mus musculus)和斑马鱼(Danio rerio)的同源性分别为97％、97％、96％、96％、96％、96％、96％、92％、91％、90％和64％.构建的系统发生树显示,鸟类和哺乳动物各形成一个大的分支,斑马鱼形成一个独立分支,与鸽的聚类顺序较近的物种为杜鹃和鸭,该结果与这些物种在生物学上的分类是基本一致的.荧光定量PCR结果显示,PPARγ基因在肺组织中的表达量最高,较高表达于肾脏、肝脏、脾脏和心脏,而在肌肉组织中的表达量最低.本研究获得了鸽PPARγ基因的cDNA序列、分子的结构特点及组织表达特征,提示可能与其在不同组织中的功能有关,该结果为进一步研究PPARγ结构和功能提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈军达	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	46	231	8.0	11.0
2	陶争荣	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	43	288	10.0	14.0
3	田勇	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	31	116	7.0	8.0
4	李国勤	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	43	208	8.0	11.0
5	陈黎	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	16	70	6.0	7.0
6	曾涛	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	11	29	4.0	5.0
7	钟声亮		2	1	1.0	1.0