紫苏PfPDCT基因序列特征及表达分析

• 作者: 任文燕 周雅莉 李润植 杨宏斌 杨慧娟 王计平 郝月茹
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 紫苏 磷脂酰胆碱甘油二脂转磷酸胆碱酶(PDCT)基因 脂肪酸代谢 生物信息学分析 表达特性
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 706-709
• 页数: 4页
• 分类号: S565.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2019.05.02

摘要

采用生物信息学技术和在线分析软件对紫苏PfPDCT基因序列及所编码的蛋白质进行分析,并且利用实时荧光定量PCR技术研究该基因在晋紫苏1号种子发育不同时期的表达特性,旨在探究磷脂酰胆碱甘油二脂转磷酸胆碱酶(PDCT)在植物脂肪酸代谢过程的作用.结果 表明,紫苏PfPDCT基因cDNA全长序列为2 098 bp,开放阅读框为1 683 bp,编码560个氨基酸残基.生物信息学分析结果表明,PfPDCT蛋白分子量约为59.315 ku,等电点为9.48,不稳定系数为35.00,推测其为稳定蛋白,与已知赤藓PDCT蛋白高度同源.通过荧光定量PCR分析可知,紫苏PfPDCT基因在不同发育时期的种子中均有表达,其中,在开花后20 d表达量最高,为开花后10d的1.92倍.研究结果可为进一步阐明紫苏PPDCT基因的功能及作用机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨宏斌	山西农业大学农学院	12	150	6.0	12.0
2	杨慧娟	山西农业大学农学院	4	26	3.0	4.0
3	王计平	山西农业大学农学院	43	243	9.0	12.0
4	周雅莉	山西农业大学农学院	10	21	3.0	3.0
5	任文燕	山西农业大学农学院	5	6	2.0	2.0
6	郝月茹	山西农业大学农学院	4	5	2.0	2.0