重组UK114蛋白编码基因的序列特征及表达分析

• 作者: 宋彩丽 尹淑琴 常泓 张晓红 殷惠军
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: UK114 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医
• 页码范围: 437-441
• 页数: 5页
• 分类号: S858.27
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2019.03.32

摘要

UK114蛋白对调节calpain活性具有重要作用,为了初步研究UK114蛋白的生物学特性,在测序的基础上,克隆和鉴定了UK114蛋白基因,分析该蛋白结构及功能预测.提取山羊肝脏中的总RNA,通过特异性引物扩增,获得UK114蛋白基因的序列,利用生物信息学方法分析了UK114蛋白的理化性质、信号肽、疏水性、糖基化、磷酸化位点,并对其二、三级结构进行预测.结果表明,克隆所得到的重组UK114蛋白基因由414个核苷酸组成,编码137个氨基酸的蛋白,其分子量约为14 ku,等电点为6.19;该蛋白氨基酸组成中丙氨酸含量最高,占15.3％,缺乏组氨酸和色氨酸;该蛋白结构中不存在信号肽,也没有糖基化位点,存在多个磷酸化位点;蛋白质二级结构中α螺旋占到了35.04％,不规则卷曲占到37.23％,β折叠占21.17％;三级结构中α螺旋位于N端,β折叠主要位于C端.该蛋白没有信号肽和糖基化位点,说明该蛋白不是分泌蛋白,不能发生糖基化,说明结构相对来说不是很稳定;有多个磷酸化位点,决定了其功能的多样性和复杂性.研究结果可为后期的蛋白质功能研究提供一定的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尹淑琴	山西农业大学生命科学学院	13	56	4.0	7.0
2	张晓红	山西农业大学生命科学学院	4	13	1.0	3.0
3	宋彩丽	山西农业大学生命科学学院	2	1	1.0	1.0
4	殷惠军	山西农业大学生命科学学院	1	1	1.0	1.0