紫苏PfPDAT1基因序列及表达特性分析

• 作者: 任文燕 周雅莉 安茜 李璐 王计平 赵静
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 紫苏 磷脂 二酰甘油酰基转移酶基因(PDAT1) 生物信息学 表达特性
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 林学与园艺
• 页码范围: 44-49
• 页数: 6页
• 分类号: S565.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.13842/j.cnki.issn1671-8151.201809002

摘要

[目的]发掘脂肪酸代谢关键酶基因,了解其编码蛋白的理化性质,探究该基因在紫苏不同组织中及不同逆境胁迫下的表达特性,为紫苏分子育种提供基因元件.[方法]利用生物信息学技术对转录组测序数据库中获得的紫苏P fPDA T1基因序列进行了分析,并采用qRT-PCR技术研究了不同逆境胁迫下该基因的表达特性.[结果]PfPDAT1基因cDNA全长序列为2 097 bp,包含1 554 bp的开放阅读框,编码517个氨基酸残基,通过预测将PfPDAT1基因编码蛋白定位于细胞质;多序列比对分析显示,P fPDA T1基因编码蛋白与芝麻和油橄榄具有较高的同源性,序列相似性分别为89％和83％;实时荧光定量PCR分析结果表明,PfPDAT1基因在‘晋苏1号’不同组织中均有表达,且在种子中表达量最高;PfPDAT1基因在NaC1、PEG6000和低温胁迫诱导时,其相对表达量有显著差异,且均在胁迫6h时表达量达到最高.[结论]PfPDA T1基因在紫苏生长发育及抵御逆境胁迫过程中起重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵静	山西农业大学农学院	25	43	4.0	6.0
2	王计平	山西农业大学农学院	43	243	9.0	12.0
3	周雅莉	山西农业大学农学院	10	21	3.0	3.0
4	任文燕	山西农业大学农学院	5	6	2.0	2.0
5	安茜	山西农业大学农学院	7	21	3.0	3.0
6	李璐	山西农业大学农学院	7	19	3.0	3.0