木薯ETR1基因克隆及表达分析

• 作者: 商桑 田丽波 胡伟 赵思涵 陈志晟 颜彦
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 木薯 乙烯受体(ETR) MeETR1基因 生理性变质(PPD) 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 19-26
• 页数: 8页
• 分类号: S533.01
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.01.003

摘要

[目的]克隆木薯乙烯受体基因(MeETR1)并检测其在木薯采后生理性变质(PPD)过程中的表达情况,为研究ETR基因家族在木薯PPD过程中的功能作用提供参考依据.[方法]以木薯品种华南8号为材料,应用PCR扩增MeETR1基因编码区(CDS)序列,采用生物信息学分析方法对其编码蛋白的理化性质、亲/疏水性、保守结构域及二、三级结构等进行预测分析,通过亚细胞定位确定MeETR1蛋白在植物细胞中的表达分布,并利用实时荧光定量PCR检测MeETR1基因在木薯采后PPD过程的表达情况.[结果]克隆获得MeETR1基因CDS序列全长2220 bp,共编码739个氨基酸,蛋白分子量为82.88 kD,理论等电点(pI)为6.76;MeETR1基因编码蛋白属于疏水蛋白,含有ETR1家族4个典型模块,即GAF结构域、HisKA结构域、HATPase_c结构域和REC结构域;其二级结构中α-螺旋占47.43％、延伸链占14.46％、无规则卷曲占38.11％.MeETR1氨基酸序列(XP_021625986.1)与同属大戟科的蓖麻(Ricinus communis)ETR1氨基酸序列(XP_002533252.1)相似性为92.42％,亲缘关系较近;MeETR1蛋白定位在细胞质中.与0 h(PPD前)相比,MeETR1基因的相对表达量在木薯采后PPD过程中(12、24、48和96 h)均呈显著下降趋势(P<0.05),即MeETR1基因表达受木薯采后PPD过程的抑制.[结论]MeETR1基因编码蛋白含有GAF、HisKA、HATPase_c和REC等4个典型的结构域,与其他植物ETR1在生物学功能上具有一致性;MeETR1基因表达在木薯采后PPD过程中受抑制,可能在此过程中发挥负调控作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田丽波	海南大学园艺学院	28	170	9.0	12.0
2	商桑	海南大学生命科学与药学院	26	159	9.0	12.0
3	颜彦	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	25	42	3.0	4.0
4	胡伟	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	35	77	4.0	7.0
5	陈志晟	海南大学园艺学院	4	3	1.0	1.0
9	赵思涵	海南大学园艺学院	2	0	0.0	0.0