木薯PYL13基因克隆及表达分析

• 作者: 商桑 田丽波 胡伟 赵思涵 陈志晟 颜彦
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 木薯 PYR/PYL/RCARs家族 MePYL13基因 生理性变质现象(PPD) 表达特征
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 2629-2637
• 页数: 9页
• 分类号: S533.01
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.12.02

摘要

[目的]解析木薯脱落酸(ABA)受体PYR/PYL/RCARs家族基因(MePYL13)在木薯块根采后生理性变质(PPD)过程中的功能作用,为后续探索ABA信号通路在木薯PPD中的功能及作物抗逆育种打下基础.[方法]从木薯品种SC8中克隆MePYL13基因,应用生物信息学分析方法对其编码蛋白的理化性质、亲疏水性、保守结构域及二、三级结构等进行预测,对基因上游启动子进行元件分析,通过亚细胞定位观察MePYL13蛋白在植物细胞中的定位情况,并利用实时荧光定量PCR检测MePYL13基因在木薯PPD过程中的相对表达量.[结果]克隆获得的MePYL13基因编码区(CDS)长度663 bp,编码220个氨基酸,蛋白分子量23.957kD,理论等电点(Ip)为6.74.MePYL13蛋白与巴西橡胶树(XP 021654464.1)PYL家族蛋白的氨基酸序列同源性最高,为91.55％,表明MePYL13蛋白氨基酸序列具有高度保守性.从MePYL13基因启动子鉴定获得与非生物胁迫逆境相关的响应元件,包括厌氧诱导元件(ARE,AAACCA)、光响应元件(ATCT-motif,AATCTAATCC)、干旱MYB元件(MBS,TAACTG)及ABA应答元件(ABRE,AAACAGA)和分生组织表达相关元件(CAT-box,GCCACT)等;MePYL13蛋白在木薯细胞的细胞核和细胞质上均有表达.随着PPD进程的推移,MeP YL13基因相对表达量整体上呈上升趋势,至PPD后期(48 h)其相对表达量是0h时(PPD前)的16倍,即MePYL13基因受木薯块根PPD的显著诱导.[结论]MePYL13基因是PYR/PYL/RCARs家族成员,可能在木薯块根PPD过程中发挥正向调控作用,为培育木薯PPD改良品种提供了潜在基因资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田丽波	海南大学园艺学院	28	170	9.0	12.0
2	商桑	海南大学园艺学院	26	159	9.0	12.0
3	颜彦	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	25	42	3.0	4.0
4	胡伟	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	35	77	4.0	7.0
5	陈志晟	海南大学园艺学院	4	3	1.0	1.0
9	赵思涵	海南大学园艺学院	2	0	0.0	0.0