木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基基因全长克隆

• 作者: 罗兴录 郭雅静 陈会鲜
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 木薯 腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase) 基因克隆 序列分析 基因全长
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 1147-1153
• 页数: 7页
• 分类号: S533
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2014.7.1147

摘要

[目的]克隆木薯腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)小亚基基因cDNA全长序列,为木薯高淀粉品种的分子育种提供依据.[方法]根据木薯AGPase小亚基基因已知片段设计特异性引物,以木薯根、茎、叶为材料,利用PCR及RACE克隆木薯AGPase小亚基基因cDNA全长序列.运用生物信息学方法对其核苷酸序列和推导氨基酸的理化性质、蛋白质三级结构进行系统分析.[结果]克隆获得木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基cDNA全长1566 bp,其中包括1566 bp的完整ORF,编码一个含521个氨基酸的多肽.其理论蛋白质分子量57.01 kDa,等电点6.1,呈酸性.多重序列比较分析结果显示,木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基核苷酸序列与蓖麻、麻风树和杨树相应序列的相似性分别为87％、87％和86％.结合系统进化树分析结果推测,木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基在不同物种及进化过程中具有高度的保守性.蛋白三级结构分析结果表明,木薯AGPase小亚基蛋白具有15个α-螺旋、24个β-折叠和多个转角.[结论]木薯AGPase小亚基基因cDNA全长序列与蓖麻、麻风树和杨树等具有较高的同源性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗兴录	广西大学农学院	115	1226	20.0	30.0
5	郭雅静	广西大学农学院	8	42	4.0	6.0
7	陈会鲜	广西大学农学院	9	76	5.0	8.0