薄荷Eβf合成酶基因(Tspa11)的克隆、序列分析与表达特性

• 作者: 刘一钒 李晓红 王丹丹
• 来源期刊: 西北林学院学报
• 关键词: 薄荷 Eβf合成酶基因 抗蚜基因 生物信息学分析 聚类分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 林木遗传与培育
• 页码范围: 90-94
• 页数: 5页
• 分类号: S567.235
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7461.2020.03.14

摘要

为克隆薄荷Eβf合成酶基因(Tspa11)、分析蛋白质结构特性与理化性质,确定其在薄荷不同组织的表达量差异,本试验以薄荷为材料,采用RT-PCR技术扩增获得Tspa11基因cDNA序列,采用生物信息学软件分析编码蛋白质的结构特性,MEGA7.0软件邻接法构建氨基酸同源性系统进化树;采用实时定量PCR技术分析Tspa11在薄荷不同组织(种子、根、茎、叶、花)的差异表达情况.结果 表明,得到Tspa11基因序列长度为1 929 bp,最大开放阅读框为71～1 723 bp,共编码550个氨基酸,分子量为63.74 ku,理论等电点(pI)5.21,偏酸性;表明Eβf合成酶是一种稳定的疏水性蛋白.NCBI保守结构域在线分析表明,Eβf合成酶基因编码的氨基酸具有Isoprenoid_Biosyn_C1 Superfamily的保守结构域(E-value:1.32e-03),蛋白氨基端位于膜内;氨基酸同源性分析,夏枯草Eβf合成酶基因与薄荷Tspa11亲缘关系最近,构成了一个小分支,同源性高达90％;夏枯草Tspa 11基因在同条件下种子的基因表达量极显著地高于其他组织(P＜0.01),根部表达量最低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李晓红	辽东学院农学院	19	54	5.0	7.0
2	王丹丹	辽东学院农学院	25	63	5.0	6.0
3	刘一钒	辽东学院农学院	1	0	0.0	0.0