大葱AfCER1基因的克隆及表达分析

• 作者: 奥娜 王永勤 裴雁曦 赵泓
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 大葱 蜡质 AfCER1 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 569-574,582
• 页数: 7页
• 分类号: S633.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2016.05.01

摘要

基于大葱RNA-seq转录组数据库中蜡质相关基因AfCER1的序列设计引物,利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术获得AfCER1(Allium fistulisum CER1)的全长cDNA序列,并通过生物信息学手段分析基因的序列;利用RT-PCR和Real-time PCR分析AfCER1基因在大葱野生型和突变型植株中的空间表达模式.结果表明,AfCER1基因全长为2 144bp,包含一个1 857 bp完整的开放阅读框(ORF),编码618个氨基酸.蛋白序列比对分析表明,AfCER1与其他物种的CER1具有相似的结构域:脂肪酸羟化酶结构域和WAX2-C结构域.由RT-PCR的结果可知,AfCER1基因在大葱的根、叶鞘、叶片等部位均有表达,且在野生型和突变型植株中的表达量有差异.Real-time PCR分析表明,在大葱的根和叶鞘及刚见光的叶片中,AfCER1在突变型植株中的表达量相对野生型少;而在见光较多的叶片部位,AfCERI在突变型植株中的表达量却比野生型多.研究可为大葱蜡质合成的分子机制提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	裴雁曦	山西大学生命科学学院	57	277	10.0	13.0
2	奥娜	山西大学生命科学学院	1	5	1.0	1.0
6	赵泓		1	5	1.0	1.0