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斜带石斑鱼BAG-1基因克隆及表达分析
斜带石斑鱼BAG-1基因克隆及表达分析
作者:
李星
吴子杰
温依铭
刘结红
蔡佳
简纪常
原文服务方:
南方农业学报
斜带石斑鱼
BAG-1基因
病原感染
免疫反应
表达分析
摘要:
【目的】明确斜带石斑鱼(Epinephelu coioides)BAG-1基因(EcBAG-1)的结构特征、组织表达分布及在脂多糖(LPS)和聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激后的表达变化,进一步揭示鱼类BAG-1在病原感染中的作用机制,也为了解鱼类的抗病免疫提供参考依据。【方法】依据EcBAG-1基因EST序列设计特异性引物克隆EcBAG-1基因,通过SMART、TMHMM Server v.2.0、SOPMA、SWISS-MODEL、ExPASy、ClustalX及MEGA 5.0等在线软件进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR检测EcBAG-1基因的组织表达特征及其在LPS和PolyI:C刺激后的表达模式。【结果】克隆获得的EcBAG-1基因开放阅读框(ORF)长624 bp,共编码207个氨基酸残基;EcBAG-1蛋白分子量为49.84 kD,理论等电点(pI)为5.18,为疏水性蛋白。EcBAG-1蛋白具有BAG-1家族保守的BAG结构域和UBQ泛素相关结构域,无跨膜结构域,主要分布在细胞质和细胞核,其二级结构中α-螺旋占65.22%、延伸链占10.63%、无规则卷曲占20.29%、β-转角仅占3.86%。EcBAG-1氨基酸序列与大黄鱼的BAG-1氨基酸序列相似性最高(96.62%),亲缘关系最近;与原鸡和热带爪蛙的亲缘关系相对较远,对应的BAG-1氨基酸序列相似性分别为58.45%和57.50%。EcBAG-1基因在斜带石斑鱼的肝脏、胸腺、脾脏、头肾、鳃、皮肤、肌肉、大脑、外周血淋巴细胞及心脏等组织中均有表达,且以在大脑中的相对表达量最高,显著高于在其他组织中的相对表达量(P>0.05,下同);经LPS和PolyI:C刺激24 h后,斜带石斑鱼脾脏中的EcBAG-1基因相对表达量显著上调。【结论】EcBAG-1蛋白含有BAG-1蛋白家族典型的BAG结构域和UBQ结构域,具有与哺乳动物BAG-1相似的生物学功能,即EcBAG-1基因在斜带石斑鱼抵御细菌/病毒感染的过程中发挥重要作用,为深入了解鱼类的抗感染机理拓宽了思路。
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文献信息
篇名
斜带石斑鱼BAG-1基因克隆及表达分析
来源期刊
南方农业学报
学科
关键词
斜带石斑鱼
BAG-1基因
病原感染
免疫反应
表达分析
年,卷(期)
2022,(5)
所属期刊栏目
水产科学
研究方向
页码范围
1399-1406
页数
7页
分类号
S965.334
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-1191.2022.05.022
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
版权信息
全文
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引文网络
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斜带石斑鱼
BAG-1基因
病原感染
免疫反应
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
总下载数(次)
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