鸽UCP3基因克隆、序列特征及组织表达分析

• 作者: 卢立志 曾涛 李国勤 沈军达 田勇 陈黎 陶争荣
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸽 解偶联蛋白3基因(UGP3) 克隆 生物信息学 mRNA表达
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1938-1948
• 页数: 11页
• 分类号: S823
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.11.013

摘要

解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)是线粒体内重要的转运蛋白,属于线粒体阴离子转运蛋白超家族的一员.哺乳动物UCP3参与多种生理过程,包括生热作用、活性氧生成、脂类代谢和胰岛素分泌等.目前,关于该基因在鸽(Columba livia)上的研究报道很少.本研究以白羽王鸽为研究对象,利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术,克隆UCP3基因的全长cDNA序列,运用生物信息学的方法对UCP3蛋白结构域、氨基酸同源性等进行分析;采用qRT-PCR技术检测UCP3基因在28日龄鸽不同组织中的表达情况.RACE结果表明,鸽UCP3基因(GenBank No.KU166860.1)cDNA全长1413 bp,包含75 bp的5′端非翻译区,414 bp的3′端非翻译区和924 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),共编码307个氨基酸.蛋白结构域分析表明,鸽UCP3蛋白具有3个完整的线粒体载体(mitochondrial carrier,Mito_ carr)结构域.序列比对显示,鸽与其他鸟类的UCP3氨基酸序列同源性较高(90％～93％),而与哺乳动物(72％～75％)、斑马鱼(Danio rerio)和爪蟾(Xenopus laevis)的同源性较低分别为70％和69％.构建的系统发生树显示,鸟类、哺乳动物、斑马鱼和两栖类的爪蟾分别形成一个分支,且在鸟类分支中,与鸽的聚类顺序较近的物种为鸭(Anas platyrhynchos),该结果与这些物种在生物学上的分类基本一致.qRT-PCR结果显示,UCP3 mRNA所检测的白羽王鸽多个组织器官中都有表达,其中以肺组织的表达量为最高,显著高于其他组织(P＜0.05),脾脏和肾脏的表达水平次之,肌肉和心脏组织中有少量表达,肝脏中的表达丰度最低.本研究为进一步探讨禽类UCP3基因的生物学功能提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈军达	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	46	231	8.0	11.0
2	卢立志	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	161	910	15.0	22.0
3	陶争荣	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	43	288	10.0	14.0
4	田勇	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	31	116	7.0	8.0
5	李国勤	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	43	208	8.0	11.0
6	陈黎	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	16	70	6.0	7.0
7	曾涛	浙江省农业科学院畜牧兽医研究所	11	29	4.0	5.0