甘蔗14-3-3基因克隆及表达分析

• 作者: 孔冉 罗炼芳 苏俊波
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 甘蔗 14-3-3基因 聚类分析 蛋白结构 表达 实时定量PCR
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 1757-1764
• 页数: 8页
• 分类号: S566.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.11.1757

摘要

[目的]克隆甘蔗14-3-3基因并预测分析其编码蛋白的结构,为研究甘蔗基因功能和代谢调控机制提供参考.[方法]以水稻14-3-3基因为模板,BLAST甘蔗EST数据库,依据序列拼接结果及RT-PCR技术获得编码甘蔗14-3-3蛋白的全长基因,并用生物信息学方法对该蛋白的二级、高级结构和功能活性位点进行预测.[结果]克隆得到长784bp的甘蔗14-3-3基因,最大开放阅读框为771 bp,编码256个氨基酸;该蛋白的分子量与理论等电点分别为28.88 kDa和4.79.蛋白聚类分析结果表明,甘蔗14-3-3蛋白与水稻、高粱、玉米14-3-3蛋白的同源性均在90％以上.Cn3D V.4.1预测位于第3和第5两个二聚体上的Lys-50、Arg-57、Arg-131和Try-132组成一个凹穴,是结合靶蛋白的作用面;第60、65、188、218位的4个丝氨酸是磷酸化的活性位点.实时定量PCR检测结果表明,14-3-3基因在甘蔗不同组织中均有表达,在茎和分生组织中14-3-3基因高丰度表达,可能与糖代谢和细胞分裂的调控相关;而在根中可能参与矿物元素的吸收和代谢.[结论]甘蔗14-3-3基因可作为信号转导调控蛋白的候选基因之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗炼芳	中国热带农业科学院南亚热带作物研究所	24	267	9.0	15.0
2	苏俊波	中国热带农业科学院南亚热带作物研究所	24	152	7.0	11.0
3	孔冉	中国热带农业科学院南亚热带作物研究所	8	24	3.0	4.0