猪肉pH值相关QTL整合定位与基因关联分析

• 作者: 刘璐 王军 苏玉虹 袁志发 赵会仁
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪肉 pH值 QTL Meta分析
• 年，卷（期）: 2012,（17）
• 所属期刊栏目: 畜牧-研究报告
• 页码范围: 5-11
• 分类号: S11+4|S813.3
• 字数: 3671字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6850.2012.17.002

摘要

为了整合与优化猪肉pH值相关数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),为分子标记辅助选择奠定基础,采用Meta分析,整合猪pH相关QTL,并对已知候选基因与“真实”QTL(MQTL)进行关联.收集猪肉pH值相关QTL,将其映射到美国肉畜研究中心(USDA-MARC2.0)公布的猪遗传连锁图谱,构建新的整合图谱,新图谱中的QTL簇经Meta分析,聚合为MQTL.进一步将已知候选基因映射到整合图谱,比较候选基因与各“真实”QTL的位置差异,分析其关联性.结果显示:224个原始QTL聚合成37个QTL簇,通过Meta分析,得到37个MQTL.MQTL的95％置信区间1.35～25.32 cM,相比原始QTL缩短29.20％～92.36％.其中,MQTL35、MQTL16、MQTL10、MQTL4和MQTL17的置信区间均在5 cM以内,且分别是由7、8、4、5、7个QTL聚合而成,具有较高的精确度和一致性.LYZ、RYR1、VTN、MYPN和PRKAG3基因映射到整合图谱后,分别定位在MQTL13、MQTL18、MQTL29、MQTL32和MQTL34置信区间内,可将其作为关键区域,开展深入研究工作.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁志发	西北农林科技大学理学院	74	1183	16.0	32.0
2	苏玉虹	辽宁医学院畜牧兽医学院	112	408	10.0	14.0
3	王军	辽宁医学院畜牧兽医学院	51	214	9.0	10.0
4	刘璐	辽宁医学院基础医学院	19	23	2.0	4.0
5	赵会仁	辽宁医学院基础医学院	17	13	2.0	3.0