全基因组关联定位籼稻种质资源外观和加工品质QTL

• 作者: 方雅洁 朱亚军 吴志超 陈凯 申聪聪 石英尧 徐建龙
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 籼稻种质资源 外观与加工品质 全基因组关联分析 数量性状座位
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 32-42
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2018.00032

摘要

以400份籼稻变异丰富的种质资源材料在2个环境下考察外观与加工品质性状表型, 利用404k高密度SNP基因型进行全基因组关联分析, 挖掘影响外观与加工品质性状的重要位点。结果表明, 粒形和籼米的外观和加工品质密切相关, 垩白性状降低稻米的精米率和整精米率, 除粒形外, 籼稻的外观和加工品质明显受到环境影响。全基因组关联分析共鉴定到39个QTL, 其中17个为新位点, 6个新位点(qMRR9、qGL2、qGL10、qGW1、qGLWR1和qGLWR2.1)在2个环境下均被检测到, 暗示这6个位点在水稻外观与加工品质上可能是不依赖于环境稳定表达的QTL。此外, 21个控制稻米外观品质的位点很可能具一因多效。结合前人研究结果, 我们推论qSW5、GSE5和GS3在籼稻外观和加工品质性状上扮演着关键性角色。研究结果为克隆新的外观与加工品质基因, 以及通过分子手段加速培育优质高产籼稻新品种提供了指导信息。