不同环境基于高密度遗传图谱的稻米外观品质QTL定位

• 作者: 彭强 李佳丽 张大双 姜雪 邓茹月 吴健强 朱速松
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 水稻 外观品质 QTL 高密度遗传图谱 高通量测序
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1248-1255
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2018.01248

摘要

为解析稻米外观品质遗传基础, 挖掘稳定存在的控制稻米外观品质性状的QTL, 本研究以籼稻品种V20B和爪哇稻品种CPSLO17作为亲本, 构建包含150个重组自交家系(recombinantion inbred line, RIL)的RIL作图群体, 进行外观品质性状QTL定位分析。利用特定位点扩增长度测序(SLAF-seq)技术, 构建了一个由12个连锁群包含8602个标记, 平均间距为0.29 cM的高密度遗传图谱。采用IciMapping 4.0软件的ICIM-ADD方法在3种环境(贵阳、贵定、三亚)对4个外观品质性状(粒长、粒宽、垩白度和垩白粒率)进行QTL (quantitative trait locus)定位分析。结果表明: 3种环境共检测到9个粒长QTL、6个粒宽QTL、3个垩白度QTL和4个垩白粒率QTL; 有5个QTL在多个环境被重复检测到, 其中3种环境都定位到的粒宽QTL qGW5-1和垩白度QTL qCha5-1为同一定位区间(第5染色体的Marker1642127Marker1514505); 此外, 垩白度QTL qCha5-2的定位区间(Marker1554573Marker1554589)和垩白粒率QTL qCGP5-2也是一样的。序列比对发现QTL qCha5-1定位区间仅51.5 kb, 是新的垩白性状主效QTL。本研究结果不仅为挖掘新的外观品质性状基因奠定基础, 也有助于开发新的分子标记进行水稻外观品质性状遗传改良。