玉米高密度SNP遗传图谱构建及其秃尖QTL定位

• 作者: 何静丹 时成俏 王兵伟 覃嘉明 覃永嫒 郑加兴 韦绍丽 黄安霞
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 玉米 秃尖 SNP 遗传图谱 QTL定位
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 1316-1324
• 页数: 9页
• 分类号: S513
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.06.010

摘要

[目的]构建在秃尖性状上存在明显差异的玉米高密度SNP遗传图谱,并对其秃尖QTL进行定位,为玉米秃尖分子机理研究及玉米抗秃尖品种选育提供理论参考.[方法]以无秃尖性状的自交系S群411331为母本、有秃尖性状的自交系综53313为父本,通过杂交和自交获得F2代群体.利用容量达10K的分子芯片获取大量SNP分子标记,从中筛选出具有多态性的SNP分子标记,构建F2代群体的高密度遗传图谱,并结合秃尖表型数据,分别采用QTL定位软件Rqtl和QTL.gCIMapping.GUI 1.1对相应的秃尖QTL位点进行鉴定及定位.[结果]F2代群体的平均秃尖长度为4.25 cm,说明其秃尖性状更偏向于父本综53313,秃尖整体较长,且秃尖变幅为0～6.1 cm,偏度和峰度值均位于-1.00～1.00,符合数量性状的分布特征.从2612个多态SNP分子标记中共筛选出2599个SNP分子标记成功构建遗传连锁图谱,总图距5624.38 cM,标记间平均距离2.27 cM.利用Rqtl共检测到6个QTL,分别位于第3、4、5、6、8和9染色体,其中加性效应和显性效应最大的2个QTL分别位于第6和8染色体,解释遗传变异的14.4％和16.3％.利用QTL.gCIMapping.GUI 1.1共检测到9个QTL,分别位于第1、4、5、6、8和9染色体,显性效应和加性效应最大的2个QTL分别位于第6和8染色体,与Rqtl检测结果相比,二者均在第8和9染色体的同一位置检测到1个QTL,在第5染色体检测到的QTL位置也较邻近,且效应最大的2个QTL均位于第6和8染色体;不同之处在于Rqtl在各染色体上只检测到1个QTL,而QTL.gCI-Mapping.GUI 1.1在第6和8染色体分别检测到2和3个QTL,在第1染色体检测到1个QTL,在第3染色体未检测到QTL,而Rqtl检测出的第1和3染色体QTL情况相反.[结论]玉米秃尖QTL分别位于第1、3、4、5、6、8和9染色体,其中主效QTL在第6和8染色体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王兵伟	广西农业科学院玉米研究所	22	112	7.0	9.0
2	覃永嫒	广西农业科学院玉米研究所	21	101	7.0	8.0
3	覃嘉明	广西农业科学院玉米研究所	18	85	6.0	7.0
4	黄安霞	广西农业科学院玉米研究所	18	86	6.0	8.0
5	时成俏	广西农业科学院玉米研究所	22	110	7.0	9.0
6	郑加兴	广西农业科学院玉米研究所	17	74	5.0	7.0
7	何静丹	广西农业科学院玉米研究所	4	13	2.0	3.0
8	韦绍丽	广西农业科学院玉米研究所	1	0	0.0	0.0