采用GBS-seq技术构建甜瓜高密度遗传图谱

• 作者: 伊鸿平 张健 张学军 张永兵 李寐华 杨文莉 杨永 郭丽霞
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 关键词: 甜瓜 GBS 遗传图谱 霜霉病 QTL
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 园艺·林业·生理生化
• 页码范围: 1828-1838
• 页数: 11页
• 字数: 7265字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2019.10.008

摘要

[目的]构建甜瓜高密度遗传图谱,为研究甜瓜重要性状基因定位及功能分析奠定基础.[方法]以甜瓜材料K7-4(高抗霜霉病)和K7-2(高感霜霉病)为亲本,杂交再自交得到F2分离群体.构建GBS文库并进行双末端测序,使用滑动窗口的方法进行基因型分型,SAM TOOLS软件检测SNP位点,采用Joinmap 4.0软件进行排图,用perl SVG模块绘制连锁图,用win QTL cart 2.5进行QTL检验,根据复合区间作图法,使用R/qtl软件包进行QTL定位.[结果]构建了总长为4823.55 cM的遗传图谱,标记间平均遗传距离为1.43 cM.在苗期、生长中期和生长后期共检测到26个与甜瓜霜霉病性状相关的QTL.[结论]基于GBS-seq技术获得了甜瓜高密度遗传图谱,最终将抗霜霉病基因关联到CM3.5.1 scaffold00005上的6,831,227～7,830,935 bp,约1Mb的区间范围内.