马铃薯资源晚疫病抗性的全基因组关联分析

• 作者: 蒋伟 潘哲超 包丽仙 周福仙 李燕山 隋启君 李先平
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 马铃薯 晚疫病抗性 全基因组关联分析 抗性基因 国际马铃薯中心
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 245-261
• 页数: 16页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2021.04099

摘要

广谱抗性基因的挖掘是马铃薯高抗晚疫病品种选育的基础。本研究以288份国际马铃薯中心筛选的晚疫病抗性群体为试验材料, 经过连续2年田间调查, 计算AUDPC和sAUDPC值, 评估群体晚疫病抗性; 利用SLAF-seq方法进行群体简化基因组测序, 通过对晚疫病抗性表型数据的全基因组关联分析, 挖掘晚疫病抗性相关的遗传位点和候选基因, 为晚疫病抗性品种选育和抗病机理研究提供一定的理论和材料基础。结果表明, 晚疫病抗性在288份材料间存在着广泛的遗传差异; 基于5种分析模型, 共鉴定到82个与晚疫病抗性显著关联的位点; 在关联区间关联到54个已知或可能与晚疫病抗性相关的基因。其中, 23个基因为抗性基因, 包括晚疫病抗性基因R1同源基因、Sw-5同源基因(R8)和Rpi-vnt1以及编码多效性耐药蛋白基因; 5个基因编码MAPK蛋白和WRKY转录因子; 1个基因参与茉莉酸途径; 3个基因与水杨酸途径相关; 6个基因是病程相关的基因; 3个基因参与苯基丙酸类合成途径; 其他与晚疫病抗性相关的基因, 如HMGR基因(2个)、细胞色素P450 (21个)。